直肠息肉分类均按组织学表现和病理性质划分。

1、新生物：计有管状腺瘤、管状绒毛腺瘤、绒毛腺瘤和家族性腺瘤息肉病。这类息肉是由肠上皮生长的新生物，极易发生癌变。

2、错构瘤：这类肿瘤是正常组织的异常混合，一种或数种组织过度生长的肿瘤。包括：幼年息肉、幼年息肉病、黑斑息肉和黑斑息肉综合征。息肉一般不会恶变，但息肉病则多会恶变。

3、炎性息肉：即假息肉，由肠粘膜溃疡而引起。常见的有：慢性溃疡性结肠炎、良性淋巴样息肉和良性淋巴样息肉病，属正常淋巴组织，与癌变无关。

4、增生性息肉：又叫化生性息肉。是在直肠和结肠粘膜上的无蒂小结节，可单个孤立，也可多发，颜色与周围粘膜相同，直径仅有几毫米，一般无症状，多并发腺瘤。

5、综合征类：该类病在肠胃内有息肉，在胃肠道外有特殊表现。